a múzeum állandó képtárának alapját Dr. Gegesi Kiss Pál egyetemi tanár ajándéka vetette meg 1957-ben, amely „Forgách Hann Erzsébet emlékgyűjtemény” címet kapott. A gyűjteményben 20. századi magyar festők képei és rajzai szerepelnek (Derkovits, Berény, Ferenczy, Rippl-Rónai, Gulácsy, Márffy, Diener Dénes, Czóbel, Bernáth, Kmetty, Barcsay, Egry, Gadányi stb), valamint Forgách Hann Erzsébet45 szobra és 80 rajza. Ehhez csatlakozik Tamás Henrik jelentős gyűjteménye (főleg Rudnay Gyula és Mednyánszky László képei), amelyet Pécs városa 1959-ben évjáradéjra vásárolt meg a tulajdonostól. Utóbb Dési Huber István rajzai és linóleummetszet-sorozata gyarapították a képtár anyagát, amely Dési Huber Istvánné több mint ezer darabot számláló ajándékaként került a gyűjteménybe. Az 1928-ban alapított Zsolnay-múzeum mintegy 11 000 db művészi porcelánt őriz. A képtár az 1904-ben megalakult Pécsi Városi Múzeum (Janus Pannonius Múzeum) egy része. Ennek régészeti osztálya gazdag őskori és népvándorlás kori anyagot őriz. Kiemelkedő részlege a zengővárkonyi korarézkori emlékanyag. Jelentős a bronzkori, vaskori, római, avar és Árpád-kori anyag. Kőtára az ókeresztény és koraközépkori emlékek egyik leggazdagabb gyűjteménye hazánkban. Jelentás néprajzi és természetrajzi anyaggal is rendelkezik.
